2011年5月26日下午4：00 丰盛堂A106 美国 New York University巫瑞波博士学术报告

　报告题目：QM/MM Molecular Dynamics Simulation of Zinc Enzyme: catalytic mechanism, stucture and function of zinc coordination

　　报告人：巫瑞波 博士 美国New York University

　　主持人：赵存元 教授

　　时  间：2011年5月26日（星期四）下午4：00

　　地  点：丰盛堂A106

　　欢迎老师和同学们参加！

美国 New York University巫瑞波博士简介

　　巫瑞波， 男，1984年生，博士。2006年6月获得厦门大学化学专业理学学士学位，2010年11月获得厦门大学量子化学专业博士学位。在厦门大学就读博士期间，获得过“宝钢优秀学生奖”以及“联想计算化学奖”。并且通过国家公派留学的方式，从2008年9月到2010年9月在美国纽约大学(New York University)化学系进行计算生物方面的学习与研究，目前在纽约大学化学系从事博士后工作。主要研究领域：(1) 酶体系特别是金属锌酶体系的量子力学/分子力学(QM/MM)组合方法研究：主要探讨酶的内在的催化反应机制，酶结构与功能的关系，以及蛋白质与小分子(底物/抑制剂)之间的相互作用。研究涉及了磷酸葡萄糖异构酶（PGI）、鼠李糖异构酶(RhI)、甲基转移酶(MT)、组蛋白去乙酰化酶(HDACs)、IAG-核苷水解酶(NH)、磷酸三酯酶(PTE)、固氮酶MoFe蛋白、一氧化碳脱氢酶(CODH)以及嗜热菌蛋白酶(TLN)。(2) 金属锌酶体系的力场(Force Field)发展：由于传统力场普遍对锌配位结构描述不好，这里采用non-bonded模型，通过设计短程-长程有效函数(SLEF)的方案用来处理中心二价锌离子与周围其它原子间的静电相互作用，并应用ab initio QM/MM Force Matching的方法，发展了Amber99SB-SLEF1力场并用于Zn酶体系的模拟。分子动力学模拟证实，相比传统的锌酶力场，SLEF力场的精确性及可移植性都有很大的提高。

一作论文：

(1). R. Wu, Z. Lu, Z. Cao and Y. Zhang J. Am. Chem. Soc.(communication) 2011, 133, 6110.

(2). R. Wu, Z. Lu, Z. Cao and Y. Zhang J. Chem. Theory Comput. 2011, 7, 433.

(3). R. Wu, S. Wang, N. Zhou, Z. Cao and Y. Zhang J. Am. Chem. Soc. 2010,132, 9471.

(4). R. Wu, P. Hu, S. Wang, Z. Cao and Y. Zhang J. Chem. Theory Comput. 2010, 6, 337.

(5). R. Wu, H. Xie, Y. Mo and Z. Cao J. Phys. Chem. A. 2009, 113, 11595.

(6). R. Wu, H. Xie, Z. Cao and Y. Mo J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 7022.

(7). R. Wu, and Z. Cao J. Comput. Chem. 2008, 29, 350